آیتالله سید محمد موسوی خوئینی در پیامی ضمن تسلیت شهادت آیتالله خامنهای، این واقعه را «فوزی عظیم» و پاداش سالها مجاهدت در مسیر تبیین معارف دینی دانست و تأکید کرد: سنگینی این مصیبت نباید موجب ناامیدی شود و همه شهروندان به حکم وظیفه الهی و ملی باید از نظام قانونی مستقر حمایت کنند.
